Il est également peu développé à cause de sa peau particulièrement épaisse. Sa sensibilité à la douleur est ainsi limitée mais cela ne veut pas dire qu'elle ne ressent rien et qu on peut lui faire mal ! C'est un être qui reste fragile malgré la carapace qui la protège. D'ailleurs, sa carapace est pourvue de nerfs et de capillaires sanguins, cela signifie qu'elle est plus sensible que l'on pense. Vous remarquerez que la tortue réagit quand vous touchez délicatement sa carapace.
La perception de la chaleur est en revanche bien développée. Mais, contrairement à nous, elle est incapable de réguler la température de son corps car elle a le sang froid ! Afin de maintenir une température corporelle entre 15 et 35 degrés, elle se déplace. Il est donc important de maintenir une température ambiante stable et adaptée à l'espèce ( Voir Aménagement intérieur pour les tortues de terre et Aménagement intérieur pour les tortues d'eau). La température est perçue par des cellules appelées thermorécepteurs présentes sur tout son corps (peau et carapace), elles sont néanmoins plus nombreuses sur la tête, le nez et les pattes.